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発表順
1981年
月夜見（ブロンズ社）
1982年
仮想恋愛（青林堂）
1983年
夏は来ぬ（青林堂）
1985年
夕顔（日本文芸社）
見晴らしガ丘にて（実業之日本社）
猫っかぶりゼネレーション（実業之日本社）
ラストダンス（日本文芸社）
1986年
悲しき街角（河出書房新社）
1988年
美しの首（角川書店）
わたしに似た人（日本文芸社）
水の蛇（角川書店）
1989年
遠くにありて　第1巻（小学館）
1990年
水鏡綺譚　上巻（角川書店）
HORIZON BLUE（青林堂）
説経　小栗判官（白泉社）
1991年
遠くにありて　第2巻（小学館）
1991年
移り気本気（新潮社）
1992年
水鏡綺譚　下巻（角川書店）
ルームメイツ　第1巻（小学館）
瓢かわいや（白泉社）
1993年
猫の草子（白泉社）
ルームメイツ　第2巻（小学館）
1994年
妖霊星（青林堂）
見晴らしヶ丘にて（ちくま文庫）
影姫（マガジンハウス）
極楽ミシン（新潮社）
1995年
心の迷宮　第1巻（小学館）
美しの首（ちくま文庫）
ルームメイツ　第3巻（小学館）
猫っかぶりゼネレーション　上巻（青林堂）
猫っかぶりゼネレーション　下巻（青林堂）
1996年
アカシアの道（双葉社）
花散る里（白泉社）
蛇苺の庭（マガジンハウス）
心の迷宮　第2巻（小学館）
1997年
ルームメイツ　第4巻（小学館）
1998年
春来る鬼（青林工藝舎）
大きな木の下で※（小学館）
アネモネ駅（青林工藝舎）
心の迷宮　第3巻（小学館）
1999年
ルームメイツ　第1巻（小学館文庫）
ルームメイツ　第2巻（小学館文庫）
ルームメイツ　第3巻（小学館文庫）
あけがたルージュ　第1巻（小学館）
遠くにありて（小学館文庫）
ホライズンブルー（青林工藝舎）
月影の御母（朝日ソノラマ）
2000年
赤い爪（青林工藝舎）
アカシアの道（青林工藝舎）
2001年
火宅（青林工藝舎）
ヴァージニア（青林工藝舎）
あけがたルージュ　第2巻（小学館）
2002年
雪夜の告白（青林工藝舎）
鋼の娘（祥伝社）
2003年
説教　小栗判官（ちくま文庫）
独りの夜も長くない（小学館）
絹の紐（太田出版）
私たちの着物術※（河出書房新社）
2004年
水鏡綺譚（青林工藝舎）
お悩み解決! 着物術※（河出書房新社）
妖霊星―身毒丸の物語（青林工藝舎）
後には脱兎の如し※（晶文社）
2005年
中・高生のための狂言入門※（平凡社）
移り気本気（青林工藝舎）
2006年
うきうきお出かけ着物術※（河出書房新社）
心の迷宮　上巻（ホーム社漫画文庫）
心の迷宮　下巻（ホーム社漫画文庫）
あしたも着物日和※（徳間書店）
兄帰る（小学館）
宝の嫁（ぶんか社）
2007年
見晴らしガ丘にて 完全版（青林工藝舎）
2008年
夜長姫と耳男（小学館）
鬼にもらった女（青林工藝舎）
2009年
花散る里（青林工藝舎）
桜の森の満開の下 （小学館）
着物いろはがるた※（徳間書店）
2010年
あしたも着物日和※（徳間文庫）
逢魔が橋（青林工藝舎）
2011年
ゆうやけ公園（徳間書店）
2012年
恋スル古事記（角川書店）
戦争と一人の女（青林工藝舎）
2014年
五色の舟（エンターブレイン）
宝の嫁（エンターブレイン）
異神変奏（メディアファクトリー）
2015年
説教　小栗判官（エンターブレイン）
新装版　アカシアの道（青林工藝舎）
近藤ようこ初期作品集 I 仮想恋愛（青林工藝舎）
猫の草子（KADOKAWA）
死者の書　上（KADOKAWA）
水鏡綺譚（筑摩書房）
2016年
月影の御母（KADOKAWA）
美しの首（KADOKAWA）
死者の書　下（KADOKAWA）
2017年
夢十夜（岩波書店）
水の蛇（KADOKAWA）
帰る場所（KADOKAWA）
夜長姫と耳男（岩波書店）
桜の森の満開の下 （岩波書店）
たそがれの市（KADOKAWA）
2018年
蟇の血（KADOKAWA）
DIX NUITS DLX RÊVES（Philippe Picquier）
2019年
見晴らしガ丘にて　それから（ホーム社）
La Dote Della Sposa（Coconino Press）
Una donna e la guerra（Dynit Manga）
Une femme et la guerre（Philippe Picquier）
2020年
夢十夜（岩波現代文学文庫）
ゆうやけ公園（青林工藝舎）
高丘親王航海記（KADOKAWA）
2021年
兄帰る（イースト・プレス）
アンソロジー収録作品